|
---
|
Bc.
Jana
Havlíková
|
M2
|
doc. Ing. Irena Jarošová, Ph.D.
|
Studium metabolomu a mikrobiomu na myším APP modelu Alzheimerovy choroby
|
detail
Studium metabolomu a mikrobiomu na myším APP modelu Alzheimerovy choroby
Metabolom je přímou odpovědí biologického systému na genetické, enviromentální či biologické změny. Kromě toho je ovlivněn i střevní mikrobiotou, která se podílí na správné metabolické a imunitní funkci, jelikož produkcí metabolitů komunikuje s centrální nervovou soustavou skrze obousměrnou osu mikrobiom-střevo-mozek. Přestože neexistuje definice zdravého složení střevní mikrobioty, narušení rovnováhy podáním antibiotik, obezitou či stresem může přispívat k neurodegenerativním onemocněním jako je Alzheimerova choroba. Cílem této práce je studium metabolomických změn a mikrobiální diverzity vyvolaných vysokotukovou dietou a léčbou (liraglutid a lipidovaný analog peptidu uvolňující prolaktin) ve fekálních vzorcích myšího modelu s patologií amyloidu β simulující ranou fázi Alzheimerovy choroby. Mikrobiální složení bylo stanoveno pomocí Illumina Mi-seq technologie, a metabolom byl analyzován necílenou metabolomikou na kapalinové chromatografii s hmotnostní spektrometrii. Vlivem vysokotukové diety byly identifikovány významně změněné metabolity (p<0,05) ze skupin aminokyselin, dipeptidů, nukleotidů a nukleosidů, zároveň došlo ke změně zvýšení poměru mikrobiálních kmenů Firmicutes/Bacteroidetes, který bývá spjat s obezitou. Vliv léčby se projevil pouze na úrovni fekálního mikrobiomu.
|
|
---
|
Bc.
Šimon
Šuda
|
M2
|
PharmDr. Petra Cihlářová, Ph.D.
|
Stanovenie aloínu v prípravkoch obsahujúcich Aloe vera
|
detail
Stanovenie aloínu v prípravkoch obsahujúcich Aloe vera
Aloe vera (L.) Burm.f. je populárna rastlina, ktorá je známa už od staroveku. Využitie aloe našlo najmä v tradičnej medicíne a kozmetike. V modernej dobe sa používalo hlavne pri kožných poraneniach, alebo ako laxatívum. List tejto rastliny je rozdelený na tri časti – kôru, latex a gél. V doplnkoch strany sa používa gél, pre jeho blahodarné účinky, na rozdiel od latexu, ktorý sa pri spracovaní aloe odstraňuje. Obsahovo najvýznamnejšiu skupinu látok latexu tvoria antrachinóny. Z nich sú najviac zastúpené antrachinónové glykosidy nazývané aloín A a jeho isoforma aloín B. Práve kvôli aloínom sa aloe dostalo pozornosti, pretože v roku 2002 americká FDA informovala o potencionálnej hrozbe rakovinotvorného pôsobenia aloínov. Z tohto dôvodu sa pre obsah aloínov v potravinách a doplnkoch výživy stanovil prísny limit (100 ng/ml), aby konzumácia produktov s extraktom z aloe nepredstavovala pre spotrebiteľa žiadnu hrozbu. Predmetom tejto práce bolo stanoviť obsah aloínov v tekutých doplnkoch stravy. Najskôr bola vybraná najvhodnejšia metóda extrakcie, a to za pomoci ethylacetátu, NaCl a ethanolu. Pre analýzu bol použitý UHPLC systém s detekciou hmotnostným spektrometrom. Zo získaných dát bolo kvantifikované množstvo aloínov v komerčných prípravkoch a zistené či spĺňajú daný limit.
|
|
---
|
Bc.
Oleksandr
Tohobitskyi
|
M2
|
doc. Ing. Martin Halecký, Ph.D.
|
Biodegradace a recyklace polyuretanových materiálů
|
detail
Biodegradace a recyklace polyuretanových materiálů
Polyuretan je v současné době jeden z nejpoužívanějších syntetických polymerů na světě. Výzkum biodegradace různých typu polyuretanů přispívá přes zpětnou vazbu k vývoji nových typů materiálů, a následně také moderních způsobů degradace nebo recyklace polyuretanového odpadu, který aktuálně zatěžuje životní prostředí. V experimentální části byly otestovány mikroorganismy, které byly izolovány z půdy při kompostování (biodegradaci) polyuretanu (dvě bakterie a dvě plísně). U těchto izolátů byla otestována schopnost degradovat experimentální polyuretanovou pěnu na bázi alifatických polyesterů, která zde figurovala jako jediný zdroj uhlíku a energie. Experimenty byly provedeny s využitím systému OxiTop®, který zaznamenává spotřebu kyslíku v průběhu kultivace. Účinnost degradace byla sledována pomocí HPLC analýzou produktů degradace. API ZYM® kity byly využity k základnímu screeningu enzymového profilu studovaných izolátů. Následně byla použita fluorescenční metoda pro podrobnější studii aktivit vybraných enzymů (esterázy a proteázy), které jsou schopné degradovat vazby přítomné v použitém polyuretanu. Z výsledků plyne, že plísňové izoláty jsou vhodnější jak pro biodegradaci materiálu, tak pro produkci enzymů použitelných pro recyklaci výchozích surovin polyuretanových materiálů.
|
|
---
|
Bc.
Lucie
Peštová
|
M2
|
Aristeidis Tsagkaris, M.Sc., Ph.D
|
Optické biosenzory pro studium polymerních nosičů pro transport léčiv
|
detail
Optické biosenzory pro studium polymerních nosičů pro transport léčiv
Cílem této práce je detekce uvolňování léčiva dexametazon z polymerního nosiče pomocí SPR biosenzoru. SPR biosenzory jsou biosenzory s povrchovou plazmonovou rezonancí. Povrchový plazmon lze definovat jako speciální elektromagnetickou vlnu, která se po vybuzení (bílým světlem) šíří po kovovém (nejčastěji zlatém) povrchu nebo je k němu vázána. Léčivo dexametazon bylo na kopolymerní pHMPA nosič ukotveno pomocí pH senzitivního linkeru OPB (ester 4-(2-oxopropyl benzoové kyseliny)), který má zajistit jeho uvolnění až v postižené (zánětlivé, nádorové) tkáni na základě poklesu pH z fyziologické hodnoty 7,4 na 5-6. Uvolňování tak bylo sledováno v pufru při pH 7,4 a 5. Byly také provedeny optimalizační kroky pro zjištění optimálního množství léčiva navázaného na polymer (5 % a 10 %). Z důvodu získání větší odezvy senzoru byl pro měření vybrán polymer s navázaným léčivem o koncentraci 10 hmotnostních %.
|
|
---
|
Bc.
Eliška
Mašková
|
M1
|
prof. Ing. Jan Masák, CSc.
|
Delece genů kódující regulační ABCF proteiny ve Staphylococcus aureus
|
detail
Delece genů kódující regulační ABCF proteiny ve Staphylococcus aureus
Podskupina ABCF proteinů náleží do rodiny ATP-vazebných proteinů (zkráceně ABC proteiny). Jedná se o jednu z nejstarších a nerozšířenějších rodin proteinů. Její zástupci jsou známí hlavně pro své transportní funkce. ABCF proteiny ale tuto transportní funkci postrádají a v buňkách plní funkce jako je například regulace syntézy proteinů nebo udělují rezistenci vůči antibiotikům. Práce se zabývá hlavně regulačními ABCF proteiny asociovanými s ribozomy v prokaryotických buňkách. U těchto ABCF proteinů není jasná jejich přesná funkce, která je ale spjatá s fungováním na ribozomech. Známým faktem je, že jsou tyto proteiny indukovány v buňkách hlavně při vystavení stresovým podmínkám. Cílem této práce bylo vytvořit deleční mutanty kmene Staphylococcus aureus USA 300 LAC postrádající geny uup, ybiT a ydiF. Následně testovat růst těchto mutant při stresových podmínkách. Výsledky těchto dat, by mohly sloužit k pochopení funkce některých ABCF proteinů.
|
|
---
|
Bc.
Petr
Otáhal
|
M2
|
Ing. Lukáš Jelínek, Ph.D.
|
Nové české odrůdy chmele a jejich využití v pivovarství
|
detail
Nové české odrůdy chmele a jejich využití v pivovarství
Český chmel je celosvětově známý zejména díky tradičním českým odrůdám jako Žatecký poloraný červeňák. V posledních letech však vzrůstá poptávka také po nových chmelových odrůdách se specifickými vlastnostmi, ať už botanickými či chemotaxonomickými. Mezi tyto odrůdy se řadí Saaz Brilliant, Saaz Comfort a Saaz Shine, které jsou svými kvalitativními vlastnostmi a obsahem pivovarsky hodnotných látek velmi blízké Žateckému poloranému červeňáku, mají však znatelně vyšší výnosnost a obsah α- kyselin. Dále jsou to vysokoobsažné odrůdy Boomerang a Gaia, které mezi českými odrůdami nejvyššího obsahu α- kyselin. Svým vysokým obsahem silic a jejich složením mohou navíc najít uplatnění také jako chmely vhodné pro jejich aromatický charakter. Dosahují také poměrně vysokého obsahu prenylovaných flavonoidů a mohou být využity pro výrobu piv s cíleně zvýšeným obsahem těchto látek.
|
|
---
|
Bc.
Markéta
Gabrielová
|
M1
|
doc. Ing. Irena Jarošová, Ph.D.
|
Aditivní účinky antibiotik a přírodních látek na buňky rodu Candida
|
detail
Aditivní účinky antibiotik a přírodních látek na buňky rodu Candida
Rod Candida je oportunní lidský patogen, který může způsobit vážná onemocnění. Na patogenitě mikroorganismů se podílí virulentní faktory, mezi které řadíme mimo jiné tvorbu biofilmu a produkci enzymů (např. fosfolipázy, proteázy). K léčbě infekcí způsobených rodem Candida se často využívají látky klotrimazol a flukonazol. V poslední době však pozorujeme trend zvyšující se rezistence především vůči flukonazolu. Cílem této práce je najít alternativní cestu léčby, která kombinuje účinek dostupných antibiotik s přírodními látkami (Bioswellix, vinný extrakt). Vliv kombinace látek byl testován na buňky biofilmu čtyř kmenů Candida (C. tropicalis DBM 2166, C. parapsilosis CCM 8260, C. parapsilosis DBM 2165, C. krusei CCM 8271). Největší inhibiční efekt měla kombinace flukonazolu s Bioswellixem na kmen C. tropicalis DBM 2166, kdy při kombinaci 5 mg/l Bioswellix + 25 mg/l flukonazol došlo k omezení tvorby biofilmu o 73,4 % oproti kontrole. Z řady virulentních faktorů byl otestován vliv na proteázovou, fosfolipázovou a hemolytickou aktivitu a hydrofobicitu buněčného povrchu buněk biofilmu. Kombinace 20 mg/l Bioswellix + 25 mg/l klotrimazol účinně snížila fosfolipázovou aktivitu u kmene C. krusei CCM 8271.
|
|
---
|
Bc.
Kateřina
Bašusová
|
M2
|
Ing. Silvie Rimpelová, Ph.D.
|
Antiproliferační účinky fluorescenčních a fototoxických konjugátů taxolu s BODIPY
|
detail
Antiproliferační účinky fluorescenčních a fototoxických konjugátů taxolu s BODIPY
Taxol je mitotický jed, který efektivně inhibuje proliferaci nádorových buněk. Působí však i na buňky nenádorové a jeho použití tak vede k řadě nežádoucích účinků. Proto jsou vyvíjeny deriváty taxolu zvyšující jeho selektivitu k nádorovým buňkám a kombinovaná léčiva pro využití v teranostice a multimodální terapii. V této práci byly studovány čtyři konjugáty taxolu, ke kterému byl v pozici C-7 nebo C-2´ připojen 4,4-difluoro-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacen (BODIPY) a jeho jodovaný derivát. Byla stanovena jejich cytotoxicita v prsních nádorových (MCF-7, UFH-001) a nenádorových (HMEpiC) buňkách, fototoxicita v buňkách MCF-7 a UFH-001 a schopnost stabilizace mikrotubulů v buňkách MCF-7 transientně produkujících tubulin ve fúzi s fluorescenčním proteinem. Bylo zjištěno, že po 72 h působí všechny konjugáty oproti taxolu na nádorové buňky méně toxicky. Toxičtěji působily na nádorové buňky konjugáty s BODIPY na C-2‘ taxolu. Nejnižší cytotoxicitu vykazovaly konjugáty v buňkách HMEpiC. Koncentračně závislá fototoxicita byla pozorována pro oba konjugáty taxolu s jodo-BODIPY. Konjugáty s vazbou BODIPY na C-2‘ taxolu (1 mM) stabilizovaly mikrotubuly po 10 a 15 min., taxol (1 mM) po 5 min., ostatní konjugáty měly nižší účinek. Výsledky ukazují dobré vlastnosti látek, budou tedy dále studovány.
|
|
---
|
Bc.
Daniela
Basařová
|
M2
|
prof. Dr. Ing. Petra Patáková
|
Charakterizace probiotické bakterie Clostridium butyricum
|
detail
Charakterizace probiotické bakterie Clostridium butyricum
Bakterie Clostridium butyricum je významným představitelem rodu Clostridium. Pro bakterie tohoto rodu je typický růst v anaerobním prostředí a schopnost vytvářet velmi odolné spory. Do většího povědomí se bakterie dostala díky schopnosti produkovat organické kyseliny, jako jsou kyseliny mléčná a máselná, které hrají významnou roli při zamezení růstu patogenních mikroorganismů v mikroflóře savců. Proto je Clostridium butyricum využívána jako probiotikum, a to jak v lékové formě (jakožto humánní probiotický doplněk stravy) nebo jako přídavek do krmiv hospodářských zvířat. O bakterii, která je považována za modelový organismus rodu Clostridium, ale existuje překvapivě málo informací. Cílem práce je proto charakterizace této bakterie. Práce se zaměřuje např. na studium její schopnosti produkovat kyselinu máselnou a mléčnou během svého růstu nebo na spotřebu růstových substrátů z média. Toto je studováno jak při individuálních kultivacích, tak při kultivaci v bioreaktoru. Dále je zkoumán vliv různých růstových podmínek, jako je vliv pH nebo přítomnost železa, a schopnost bakterie za těchto podmínek sporulovat.
|
|
---
|
Bc.
Lenka
Aichingerová
|
M2
|
prof. Ing. Alena Čejková, CSc.
|
Antimikrobiální aktivita nanočástic stříbra připravených pomocí rostlinných extraktů
|
detail
Antimikrobiální aktivita nanočástic stříbra připravených pomocí rostlinných extraktů
V současnosti dochází k velikému rozmachu využívání nanočástic a jiných nanostruktur díky jejich unikátním fyzikálně‑chemickým vlastnostem. Z nanočástic jsou to převážně nanočástice stříbra (AgNPs), které se díky svým antimikrobiálním vlastnostem, ukázaly jako velice slibný materiál pro různé aplikace v medicíně, jako součást antimikrobiálních látek, lékových nosičů a diagnostických preparátu. Tato práce se zaměřuje na antimikrobiální aktivitu nanočástic proti suspenzním buňkám grampozitivní bakterie Enterococcus faecalis (ATCC 51229), gramnegativní bakterie Klebsiella pneumoniae (ATCC 13883) a kvasinky Candida parapsilosis (ATCC 22019). Pro experimenty byly zvoleny dva vzorky biosynteticky připravených nanočástic stříbra. Monodisperzní nanočástice s velikostí v rozmezí 5‑20 nm a polydisperzní nanočástice s širším rozmezím velikostí 10‑40 nm. Testování antimikrobiální aktivity nanočástic stříbra o určitých koncentrací bylo prováděno v mikrokultivačním zařízení Bioscreen C. Nanočástice se ukázaly jako velmi účinné vůči gramnegativní K. pneumoniae a kvasince C. parapsilosis, zatímco výraznějšího snížení růstu E. faecalis nebylo dosaženo použitím ani jedné z testovaných disperzí AgNPs.
|
