|
9:00
|
Bc.
Martina
Mejzrová
|
M2
|
RNDr. Martin Flegel, CSc.
|
Peptidy s vlastnostmi inhibitorů HIV-1
|
detail
Peptidy s vlastnostmi inhibitorů HIV-1
V roce 2005 byla publikována studie o CAI [1] (capsid assembly inhibitor). Jedná se o krátký syntetický peptid, který inhibuje sbalování viru HIV-1 in vitro. Tento 12-ti aminokyselinový peptid o známé sekvenci ITFEDLLDYYGP se váže na CA podjednotku viru.
Na základě teoretické úvahy, která vychází z návrhu programu Chimera modelujícího vazebné místo pro CAI, bylo připraveno 7 analogů tohoto inhibitoru. Syntéza různě modifikovaných peptidů probíhala metodou na pevné fázi na polymerním nosiči Rink, s použitím taktiky Fmoc/tBu. Bylo využito syntetizátoru Spyder Mark III vyvinutém vývojovými dílnami ÚOCHB a Spyder Institutem Praha. Po odštěpení analogů (ve formě amidů) z polymerního nosiče byly jejich inhibiční vlastnosti testovány metodou FAITH.
Cílem práce je ovlivnit změnami ve struktuře CAI peptidu jeho biologické (inhibiční) účinky na HIV-1 virové částice.
[1]
J. Sticht, M. Humbert, S. Findlow, J. Bodem, B. Müller, U. Dietrich, J. Wemer a H. G. Kräusslich, „A peptide inhibitor of HIV-1 assembly in vitro,“ Nature Structural and Molecular Biology, sv. 12, pp. 671-677, 2005.
|
|
9:00
|
Bc.
Markéta
Šišáková
|
M2
|
Prof. Ing. Jitka Moravcová, CSc.
|
Polyvalentní fukosylkalixareny jako ligandy lektinů patogenních bakterií
|
detail
Polyvalentní fukosylkalixareny jako ligandy lektinů patogenních bakterií
Lektiny patogenních bakterií jsou schopné interagovat se sacharidy na povrchu buněk, využít je ke kolonizaci tkáně a tvorbě biofilmu. Takovéto interakce jsou proto z velké části zodpovědné za rozvoj bakteriálních infekcí, jako je například cystická fibróza. Syntéza nových polyvalentních sacharidových ligandů, působících jako kompetitory ligandů přirozených, tak může být jednou z cest vývoje nových léčiv proti bakteriálním onemocněním.
Cílem mé práce bylo připravit nové ligandy s kalix[4]arenovým skeletem a navázanou L‑fukosou jako sacharidem specifickým pro lektin LecB patogenní bakterie Pseudomonas aeruginosa a lektin BC2L-C bakterie Burkholderia cenocepaciae. Jako výchozí látku pro Huisgenovu cykloadiční reakci s tetrapropargyloxykalix[4]areny jsem připravila z 2‑(α‑L‑fukopyranosyl)ethylazidu dendron se třemi fukosylovými jednotkami, který jsem využila k syntéze nového dendrimeru obsahujícího 12 jednotek.
![]()
|
|
9:00
|
Bc.
Barbora
Toncarová
|
M1
|
Prof. Ing. Jitka Moravcová, CSc.
|
Stabilní C-disacharidy spojené triazolovým můstkem pro syntézu glykomimetik
|
detail
Stabilní C-disacharidy spojené triazolovým můstkem pro syntézu glykomimetik
Stabilní C-disacharidy spojené triazolovým můstkem pro syntézu glykomimetik V posledních několika letech se studuje problematika buněčného rozpoznávání a zjistilo se, že velkou roli v komunikaci na buněčné úrovni mají právě sacharidy, které díky svým unikátním vlastnostem fungují jako kódovací sloučeniny. Základem komunikace je pak interakce lektinového receptoru právě se sacharidy. Studium komunikace na buněčné úrovni je jedním ze základních pilířů vývoje nových léků. Glykosidová vazba ale není za fyziologických podmínek stabilní, proto se hledají stabilní analogy. Cílem práce bylo připravit C-pseudo-di-α-D-mannopyranosid 1 se spojením obou jednotek triazolovým můstkem. Biologické testování připraveného pseudodisacharidu 1 bude zaměřeno proti lektinu LecB (PA-IIL) patogenní bakterie Pseudomonas aeruginosa.
![]()
|
|
9:00
|
Bc.
Kamila
Šedivá
|
M2
|
prof. Ing. Jitka Moravcová, CSc.
|
Thiocalix[4]areny jako nosiče bioaktivních ligandů
|
detail
Thiocalix[4]areny jako nosiče bioaktivních ligandů
Na povrchu buněk se vyskytují glykanové řetězce, které interagují s endogenními lektiny, a tím zajišťují buněčnou komunikaci. Toho ovšem využívají patogeny, které jsou schopné rozpoznat sacharidové řetězce a reverzibilně se na ně vázat.
Lektiny jsou proteiny, které rozpoznávají monosacharidy, a to velmi často l-fukosu. Příkladem je bakterie Ralstonia solanaceatum, která napadá brambory, rajčata nebo lilky. Burkholderia cenocepacia je bakterie, která u pacientů s cystickou fibrózou způsobuje chronický zánět plic, který může vést až k akutnímu selhání plicní ventilace a smrti. Plíseň Aspergillus fumigatus je původcem onemocnění zvané aspergilóza, což je houbové infekční onemocnění vyskytující se u pacientů s oslabenou imunitou. Pseudomonas aeruginosa je bakterie způsobující záněty močových cest nebo infekce dýchacích cest.
Cílem práce bylo připravit originální konjugát 1 a jeho analog neobsahující tertBu skupiny Huisgenovou cykloadicí 2-(2,3,4-tri-O-acetyl-α-l-fukopyranosyl)ethylazidu s tetrapropargyloxythiokalix[4]arenem. Afinita konjugátu 1 k lektinům uvedených patogenů bude testována.
![]()
|
|
9:00
|
Bc.
Jaroslava
Šmolíková
|
M1
|
RNDr. Martin Flegel CS.c
|
Strukturované peptidy jako inhibitory enzymů
|
detail
Strukturované peptidy jako inhibitory enzymů
Výzkum a vývoj peptidů jako léčivých látek má velký realizační potenciál. Peptidy jsou charakterizovány jako vysoce selektivní, účinné a bezpečné látky. Jejich biologické účinky jsou u přírodních peptidů známy a výpočetní modelování látek de novo umožnuje jejich dokonalejší studium a návrhy pro potenciální aplikace.
V práci byly zkoumány výpočetní návrhy peptidových inhibitorů pro TEV, papain a subtilisin proteázy. Ze spektra možných struktur byly vybrány jako nejslibnější dvě lineární a dvě cyklické peptidové struktury. Tyto beta-vlásenkové 20-23 aminokyselinové peptidy byly syntetizovány metodou na pevné fázi. Cyklizace lineárních peptidů byla pak provedena CuAAC reakcí katalyzovanou mědí.
Tvorba inhibičního komplexu „strukturovaných peptidů“ byla zkoumána funkční charakterizací a inhibičním účinkem na enzymovou proteolytickou aktivitu. Tyto experimenty dosud odhalily inhibiční aktivitu pro papain proteázu. Pro porovnání proteolytické aktivity bez inhibitoru nebo v přítomnosti inhibitoru byl použit test přenosu fluorescenční rezonance (FRET). Výsledky ukázaly správnost naší hypotézy a byl pozorován významný rozdíl v enzymatické aktivitě. Další biologické experimenty jsou ve vývoji. Práce by mohla pomoci při vývoji nových selektivních a účinných inhibitorů různých druhů proteáz.
![]()
|
|
9:00
|
Bc.
Kateřina
Housková
|
M2
|
Ing. Kamil Parkan, Ph.D.
|
Příprava pinakol boronátu pro syntézu C-disacharidů pomocí Bor-Wittigovy reakce
|
detail
Příprava pinakol boronátu pro syntézu C-disacharidů pomocí Bor-Wittigovy reakce
Nedávno byla nalezena nová vysoce stereoselektivní bor-Wittigova reakce stabilních a snadno získatelných geminálních bis(boronátů) s různými aldehydy, která umožňuje připravit substituované vinyl boronáty. Tyto vinyl boronáty jsou látky, které mají široké využití v organické chemii, neboť je lze využít pro různé transformační reakce jako je například Suzukiho-Miyaurova reakce, Chanův-Lamův kapling nebo Petasisova reakce.
Cílem této práce bylo nalézt vhodné reakční podmínky pro přípravu cukerných vinyl boronátů 3, které by bylo možné následně použít pro syntézu C-disacharidů. Pro přípravu vinyl boronátů 3 byla použita stereoselektivní bor-Wittigova reakce různých cukerných ketonů 1 s bis(boryl)methanem 2. Připravené vinyl boronáty 3 byly následně transformovány na aldehyd, jodid nebo byly použity pro Pd‑katalyzovanou Suzukiho-Miyaurovu reakci.
![]()
|
|
9:00
|
Bc.
Radka
Kucherková
|
M2
|
prof. RNDr. Pavel Drašar, DSc.
|
Syntéza methoxy derivátů BODIPY barviv pro biologické zobrazování
|
detail
Syntéza methoxy derivátů BODIPY barviv pro biologické zobrazování
Syntéza methoxy derivátů BODIPY barviv pro biologické zobrazování
BODIPY barviva jsou nízkomolekulární fluorescenční látky s vynikajícími fyzikálně-chemickými vlastnostmi. V rámci tématu této práce byly navrženy a syntetizovány tři série nových fluorescenčních BODIPY. Základní myšlenka práce zahrnuje derivatizaci syntetizovaných základních BODIPY barviv (6 variant) 3,4,5-trimethoxystyrylovou a 3,4,5-trimethoxyfenylovou skupinou. Výchozím strukturním motivem byla syntetizovaná zeleně emitující barviva (emise 503 - 507 nm). Následná derivatizace výchozích BODIPY byla uskutečněna Knoevenagelovou kondenzací s 3,4,5-trimethoxybenzaldehydem na α-methylu (emise produktů 581 - 584 nm) a v druhém případě Suzukiho cross-couplingem v poloze C-2 s 3,4,5-trimethoxyfenylboronovou kyselinou (emise produktů 550 - 554 nm). Celkem bylo syntetizováno 24 látek z toho 19 nových. Lokalizace sloučenin byla zobrazena pomocí konfokální flourescenční mikroskopie na rakovinných buněčných liniích (U2-OS, MCF-7, HEK 293T). Produkty Knoevenagelové kondenzace byly selektivně lokalizovány v endoplazmatickém retiukulu a vzhledem k jejich nízké cytotoxicitě mohou být použity jako nové selektivní a stabilní značky endoplazmatického retikula pro biologické zobrazování.
|
|
9:00
|
Jiří
Jakeš
|
M2
|
Prof. Ing. Jitka Moravcová, CSc.
|
Polyvalentní glykomimetika jako ligandy lektinu LecA
|
detail
Polyvalentní glykomimetika jako ligandy lektinu LecA
V posledních desetiletích jsou stále častěji objevovány nové multirezistentní bakteriální kmeny, tedy bakterie odolné vůči několika skupinám antibiotik. Z tohoto důvodu jsou hledány nové přístupy k terapii bakteriálních onemocnění. Jako jeden z perspektivních přístupů se jeví narušení rozpoznávacích procesů bakterie pomocí ovlivnění jejích povrchových proteinů (lektinů).
Lektiny jsou proteiny se schopností selektivně a reverzibilně vázat sacharidy a hrají významnou roli v procesu adheze infekčních agens. Bakterie Pseudomonas aeruginosa obsahuje dva homotetramerní lektiny LecA (PA-IL) a LecB (PA-IIL), které selektivně rozeznávají d-galaktosu a l-fukosu. Pro zvýšení afinity sacharidu k cílovému lektinu se jako vhodná strategie ukázalo spojení sacharidových jednotek do glykoklastru.
Cílem mojí práce bylo připravit galaktoglykoklastr 1 z odpovídajícího glykodendronu a propargylthiokalix[4]arenu s využitím Huisgenovy cykloadiční reakce. Připravený glykoklastr 1 je stabilní za fyziologických podmínek díky C-glykosidové vazbě a bude podroben biologickému testování na interakce s bakteriálním lektinem LecA (PA-IL).
![]()
|
|
9:00
|
Bc.
Michal
Kratochvíl
|
M1
|
doc. Ing. Vladimír Pejchal, Ph.D.
|
Aminokyseliny v syntéze inhibitorů acetylcholinesterázy – Tyrosin
|
detail
Aminokyseliny v syntéze inhibitorů acetylcholinesterázy – Tyrosin
S narůstajícím věkem se zvyšuje riziko úbytku acetylcholinu v centrální nervové soustavě, což může vést až k Alzheimerově chorobě. Jednou z možností, jak zvýšit koncentraci tohoto neurotransmiteru, je zamezení jeho hydrolytického štěpení inhibicí enzymu acetylcholinesterázy1. Mezi látky s touto schopností lze zařadit deriváty 6-fluor-1,3-benzthiazolu připravené kondenzací 2-amino-5-fluorfenylthiolátu draselného s N-karboxyanhydridy biogenních aminokyselin2. Cílem této práce byla příprava nového 4-[(2S)-2-amino-2-(6-fluor-1,3-benzthiazol-2-yl)ethyl]fenolu 1 s využitím aminokyseliny L-tyrosinu. A následná syntéza jeho derivátů v podobě vybraných Schiffových bazí 2 a sekundárních aminů 3. 1. Hampl, F.; Rádl, S.; Paleček, J.: Léčiva ovlivňující centrální nervový systém. In Farmakochemie, 3rd ed. Vysoká škola chemicko-technologická v Praze: Praha, 2015; p. 217. 2. Imramovský, A.; Pejchal V.; Štěpánková Š.; Vorcáková, K.; Jampílek, J.; Vanco, J.; Šimůnek, P.; Královec, K.; Brůčková, L.; Mandíková, J.; Trejtnar, F. Synthesis and in vitro evaluation of new derivatives of 2-substituted-6-fluorobenzo[d]thiazoles as cholinesterase inhibitors. Bioorg. Med. Chem. 2013, 21 (7), 1735–1748.
![]()
|
