Prosím čekejte...
Nepřihlášený uživatel
SVK
Nacházíte se: Studentská vědecká konference  → SVK 2018
iduzel: 43887
idvazba: 48122
šablona: stranka
čas: 29.3.2024 11:57:48
verze: 5351
uzivatel:
remoteAPIs: https://cis-prihlasovadlo.vscht.cz/svk/?year=2018
branch: trunk
Server: 147.33.89.153
Obnovit | RAW
iduzel: 43887
idvazba: 48122
---Nová url--- (newurl_...)
domena: 'svk.vscht.cz'
jazyk: 'cs'
url: '/svk-2018'
iduzel: 43887
path: 1/28821/43620/28823/43889/43887
CMS: Odkaz na newurlCMS
branch: trunk
Obnovit | RAW

SVK 2018

Sborníky SVK 2018: FCHT, FTOP, FPBT, FCHI.

Termín konání SVK

V akademickém roce 2018/19 proběhla SVK ve čtvrtek 22. 11. 2018, kdy je vyhlášen Rektorský den.

Organizace SVK

Organizace SVK je zajišťována prostřednictvím děkanátů fakult. Oddělení pro vědu a výzkum (VaV) zajišťuje elektronické vydání sborníku prací a koordinaci soutěže na fakultách.

Soutěž bude probíhat v přednáškových a posterových sekcích, výběr formy je na rozhodnutí vedení fakulty.

Minimální počet prací soutěžících v každé sekci je šest, maximální počet prací v sekci není limitován. Každý student může přihlásit jednu soutěžní práci.

Na Oddělení VaV má SVK na starosti Veronika Popová, tel. 220 44 3806, veronika.popova@vscht.cz. Dotazy ohledně elektronického přihlašovacího systému směřujte na jitka.cejkova@vscht.cz.

Časový harmonogram přípravy SVK 2018

  • Do 1. 10. 2018 jmenuje děkan fakultního organizátora SVK a jeho jméno nahlásí děkanáty na odd. VaV. Dále jmenuje pracovníky zodpovědné za organizaci jednotlivých sekcí. Fakultní a ústavní organizátoři poté budou seznámeni s elektronickým přihlašovacím systémem na stránkách http://svk.vscht.cz.
  • Od 8. 10. 2018 do 22. 10. 2018 se studenti závazně přihlásí do soutěže pomocí elektronického přihlašovacího systému http://svk.vscht.cz. K přístupu do systému použijí své školní přihlašovací údaje, vyplní ročník, jméno svého školitele a název svého příspěvku. Každý student může přihlásit jednu soutěžní práci a to s vědomím svého školitele.
  • Fakulty na základě počtu přihlášených studentů nahlásí do 25. 10. 2018 na odd. VaV počet sekcí na fakultě a počet soutěžních prací v jednotlivých sekcích.
  • Do 8. 11. 2018 studenti pomocí elektronického přihlašovacího systému nahrají anotaci svojí práce (max. 1300 znaků, max. 1 obrázek rozměru 16:9, možnosti formátování jsou návodně uvedeny v přihlašovacím systému).
  • Do 15. 11. 2018 fakultní organizátoři v elektronickém přihlašovacím systému roztřídí všechny soutěžní práce do jednotlivých sekcí na fakultě, dále uvedou názvy sekcí, místo a čas konání a složení komisí. Složení hodnotících komisí pro jednotlivé sekce určí vedení fakulty. Komise je nejméně tříčlenná a členy z řad akademických pracovníků mohou doplnit odborníci spolupracujících firem a průmyslových podniků. Předsedou komise by měl být profesor nebo docent.
  • Sborníky jednotlivých fakult budou automaticky vygenerovány na základě údajů uvedených v elektronickém přihlašovacím systému.

Seznam fakultních koordinátorů

V případě dotazů ohledně SVK se obracejte na příslušné ústavní či fakultní kordinátory, popřípadě kontaktujte Veroniku Popovou z Oddělení pro vědu a výzkum (Veronika.Popova@vscht.cz). Dotazy ohledně elektronického přihlašovacího systému směřujte na Jitku Čejkovou (Jitka.Cejkova@vscht.cz).

Další informace k soutěži

  • U příležitosti SVK je vyhlášena soutěž o Cenu Julie Hamáčkové v kategorii Studentská práce typu SVK; vyhlášení soutěže a bližší informace na http://gro.vscht.cz/cjh
  • Občerstvení pro komise a soutěžící hradí ústavy z vlastních prostředků.
  • Organizace průběhu soutěže v sekcích je výlučně věcí rozhodnutí fakult.
  • Finanční příspěvek na ocenění soutěžních prací bude hrazen z prostředků dotace na specifický výzkum (IGA 2018). Jeho výše bude stanovena dohodou proděkanů a prorektora pro VaV podle celkového počtu přihlášených soutěžních prací. Oceněna bude účast a dále první tři místa v každé sekci. Výplata příspěvku studentům bude provedena bezhotovostním převodem, zajistí děkanáty fakult. Je vítána další finanční nebo věcná podpora účastníků SVK ze sponzorských zdrojů. Její výše (hodnota), způsob rozdělení a výplaty je plně v kompetenci komise sekce.
  • Vytištění diplomů budou zajišťovat fakulty.

SVK 2018 – vyhlášení

Nejste zalogován/a (anonym)

Proteomika (prostory ústavu 320 - 9:00)

  • Předseda: prof. Dr. Ing. Radovan Hynek
  • Komise: Ing. Jitka Viktorová, Ph.D., Ing. Hana Stiborová, Ph.D., Ing. Michal Strejček, Ph.D.
Čas Jméno Ročník Školitel Název příspěvku Anotace
9:00 Bc. Nikola Ďásková M2 doc. Ing. Vojtěch Spiwok, Ph.D. Simulace dynamiky peptidů pomocí metody létajících Gaussiánů detail

Simulace dynamiky peptidů pomocí metody létajících Gaussiánů

Trojrozměrné struktury, které můžeme získat experimentálně, poskytují pouze částečný náhled na danou biomolekulu. Molekulární simulace nám však umožňují zkoumat samotnou dynamiku makromolekul. Simulace jsou ale stále moc pomalé a je těžké v nich zachytit konformační změny. Proto se snažíme vymýšlet nové metody. Hlavní metodou používanou v této práci je metoda létajících Gaussiánů vyvinuta v návaznosti na metadynamiku v naší laboratoři; další využívanou metodou je právě metadynamika. U většiny simulačních metod je nutné využívat kolektivní proměnné (parametry, které dobře charakterizují daný systém). U metody létajících Gaussiánů však tyto parametry používat nemusíme a potenciálně můžeme zkoumat i systémy, kde výběr kolektivních proměnných není triviální. Metoda létajících Gaussiánů byla úspěšně otestována na malých modelových systémech a bude využita ke zkoumání konformačního prostoru malých peptidů. Jako základní peptid využívám acetylalanin-N-methylamid, jeho deriváty a uměle navržený dekapeptid chignolin. Porovnání ploch volné energie současných výsledků naznačuje, že metoda létajících Gaussiánů je v urychlování efektivnější než metadynamika. V současnosti se snažíme o nalezení metody, která by dokázala reprezentovat konformační prostor bez znalosti kolektivních proměnných.



9:00 Bc. Daria Pikalova M2 doc. Ing. Vojtěch Spiwok, Ph.D. Design proteinů in silico s využitím strojového učení a jejich charakterizace detail

Design proteinů in silico s využitím strojového učení a jejich charakterizace

Umělé neuronové sítě byly původně navrženy jako nástroj pro modelování a studium nervové soustavy. Kvůli schopnosti se učit jsou často užívané v umělé inteligenci, jako praktické nástroje pro řešení vědeckých a inženýrských problémů. Jednou z takovýchto sítí je Char-RNN, kterou můžeme použít pro generování sekvencí proteinů na základě sekvencí reálných proteinů.  Mým úkolem bylo u takto navržených proteinů předpovědět sekundární strukturu. Vybrané sekvence pak zkrátit na 30-50 AMK a předpovědět jejich 3D strukturu. Pro tyto účely byly připraveny “fragment libraries”, pomocí nichž bylo vygenerováno více modelů prostorových struktur vybraných peptidů se zadanou sekvencí a pro každý model bylo vypočítáno skóre, popisující kvalitu modelů.  Pro sekvenci, která vykazovala přítomnost “sbalovací nálevky”, byl navržen a připraven syntetický gen, který byl ověřen sekvenováním. Následně byl exprimován v buňkách E. coli BL21(DE3). Buňky byly dezintegrovány a požadovaný protein byl přečištěn pomocí afinitní chromatografie.  Sekundární struktura peptidu byla charakterizována metodou cirkulárního dichroismu. Dle předpokladu měl peptid obsahovat přibližně 70 % a-helixů, ale ve skutečnosti peptid obsahoval pouze 9 % a-helixů. V současnosti probíhá příprava dalšího peptidu.
9:00 Bc. Alena Karnošová M2 prof. Ing. Martin Fusek, CSc. Lipidizované analogy peptidu uvolňujícího prolaktin a jejich vliv na signalizaci receptorů  detail

Lipidizované analogy peptidu uvolňujícího prolaktin a jejich vliv na signalizaci receptorů 

Obezita je v dnešní době závažný zdravotní problém. Nové možnosti ve vývoji budoucích léků proti obezitě a diabetu představují anorexigenní neuropeptidy, které se tvoří v mozku a působí na snížení příjmu potravy a tělesné hmotnosti. Tato práce se zabývá lineárními anorexigenními neuropeptidy, peptidem uvolňujícím prolaktin (PrRP) a neuropeptidem FF (NPFF), které se řadí do skupiny tzv. RF-amid-peptidů. Typickým znakem RF-amid-peptidů je zakončení C-konce sekvencí Arg-Phe-NH2, která je nezbytná pro vazbu na jejich receptory. Bylo zjištěno, že PrRP se váže na svůj přirozený receptor GPR10 a zároveň vykazuje vysokou afinitu k receptoru pro neuropeptid FF (NPFF2). Ve své práci se zabývám vybranými lipidovanými peptidovými analogy PrRP a jejich mechanismem účinku in vitro. Lipidizace analogů PrRP navržených v laboratoři skupiny RNDr. Lenky Maletínské, CSc. umožňuje vyvolání centrálního anorexigenního účinku po periferním podání, a tím nabízí možnost potenciálního terapeutického využití. Cílem je zmapovat signalizace těchto peptidů do buňky na buněčných liniích s exprimovaným receptorem GPR10 nebo s receptory s částečnou homologií ke GPR10 receptoru.  
9:00 Bc. Lucie Klimešová M2 Ing. Jan Lipov, Ph.D. Zavedení metody TANGO pro testování interakce nových syntetických drog se serotoninovými receptory detail

Zavedení metody TANGO pro testování interakce nových syntetických drog se serotoninovými receptory

Nové syntetické drogy jsou problémem současné drogové scény. Bývají navrženy jako analoga nelegálních drog za účelem obejít stávající legislativu. Jejich výrobci se snaží připravit takovou psychoaktivní substanci, která dosud není na seznamu ilegálních látek, nebo jejíž prekursory nejsou monitorovanými látkami. Detekce nových syntetických drog je velmi obtížná. Imunochemické techniky zaměřené na klasické drogy nejsou schopny většinu nových látek prokázat, protože i malá změna struktury může způsobit falešně negativní výsledek testu. Jednou z možností, jak nově syntetizované drogy zjistit je zavedení metody TANGO. Metoda TANGO je založena na principu přepisu reportérového genu pro luciferasu, který je aktivován fúzí testované látky s cílovým receptorem. Tím často bývá receptor spřažený s G-proteiny. Mým úkolem bylo zavést tuto metodu pro serotoninové receptory HTR2, které jsou cílem působení mnohých psychoaktivních drog. Pomocí této metody můžeme s jistotou určit, zda neznámá substance se serotoninovým receptorem interaguje a tudíž vykazuje psychoaktivní účinky. Cílem této práce je příprava buněčné linie produkující serotoninové  receptory se systémem TANGO, na které bude možné testovat deriváty nových syntetických drog.  
9:00 Ekaterina Simonova M2 doc. Ing. Igor Hochel, CSc. The role of mitochondrial ABC transporters in mitochondrial function and cancerogenesis detail

The role of mitochondrial ABC transporters in mitochondrial function and cancerogenesis

Cancer stem cells (CSCs), a small population of cells within the tumour characterized with self-renewal capacity and ability to give rise to a tumour in the immunocompromised mice, are believed to be the main reason for the failure of cancer treatment. CSCs are characterized by higher expression of ATP-binding cassette (ABC) transporters, which pump chemotherapeutics and various endogenous substrates across the membranes. Mitochondria are essential cellular organelles containing enzymes participating in important biological processes. There are four known mitochondrial ABC transporters: ABCB6, ABCB7, ABCB8 and ABCB10. They have exclusive function in mitochondrial processes related to iron metabolism such as iron-sulphur cluster biogenesis (ABCB7), heme biosynthesis (ABCB10, ABCB6) or mitochondrial iron export (ABCB8). These transporters are also  implicated in protection against reactive oxygen species and chemoresistance. We found differential expression of these transporters in CSCs derived from breast cancer cell lines on mRNA and also on protein level. In particular, ABCB8 was upregulated while ABCB10 was downregulated in our CSC model. Therefore, the focus of this project is to study their cellular function and their role in cancer stem cell maintenance and biology.
9:00 Bc. Veronika Bělíková M2 prof. Ing. Martin Fusek, CSc. Využití dvoufotonové polarizační mikroskopie pro studium interakce β2 adrenergního receptoru s heterotrimerním proteinem Gαs detail

Využití dvoufotonové polarizační mikroskopie pro studium interakce β2 adrenergního receptoru s heterotrimerním proteinem Gαs

Receptory spřažené s G proteiny (GPCR) a heterotrimerní G proteiny hrají významnou roli v buněčné signalizaci. G-proteinová signalizace je důležitá pro kardiovaskulární funkci, neurotransmisi a další procesy. G-proteinová signalizace je proto cílem mnoha léčiv, a znalost molekulárních aspektů G-proteinové signalizace je tudíž důležitá jak pro vědecké poznání, tak pro farmaceutické aplikace. Cílem práce je zjistit s využitím techniky dvoufotonové polarizační mikroskopie (2PPM), zda stimulační G-proteinová podjednotka Gαs v živých buňkách fyzicky interaguje se zástupci GPCR již před aktivací příslušného receptoru. Technika 2PPM sleduje tzv. lineární dichroismus (LD), tj. poměr mezi intenzitami fluorescence emitované po ozáření vzorku horizontálně a vertikálně polarizovaným světlem. LD závisí na orientaci fluoroforu, na niž mají často vliv interakce mezi proteiny. Technikou 2PPM jsme schopni citlivě sledovat interakce mezi GPCR a inhibiční podjednotkou Gαi1. Naše pozorování interakcí GPCR se stimulační podjednotkou Gαs za využití existujících konstruktů však zatím neposkytla jednoznačné výsledky. V současnosti probíhá příprava modifikovaných konstruktů na bázi podjednotky Gαs a další mikroskopická pozorování.  
9:00 Bc. Anna Neužilová M2 prof. Ing. Martin Fusek, CSc. Fragmenty peptidu uvolňujícího prolaktin: studie in vitro  detail

Fragmenty peptidu uvolňujícího prolaktin: studie in vitro 

Jednou ze světově nejrozšířenějších civilizačních chorob je obezita, která je úzce spjata s nadměrným příjmem potravy a minimálním energetickým výdejem. Neustále rostoucí výskyt obezity představuje závažná rizika spojená s dalšími zdravotními komplikacemi. Jednou z potenciálních možností léčby mohou být centrální anorexigenní neuropeptidy. Farmakologickou otázkou je však přestup neuropeptidů z periferie přes hematoencefalickou bariéru. Po periferním podání tyto látky nejsou schopné projít do mozku a vyvolat zde biologickou odezvu. Ve své práci se věnuji peptidu uvolňující prolaktin (PrRP) a jeho analogům. PrRP patří do rodiny RF-amidových peptidů a po centrálním podání snižuje příjem potravy. Připojením mastné kyseliny je PrRP schopen způsobit anorexigenní účinek i při periferním podání. PrRP se váže na receptor GPR10 a vykazuje afinitu i k receptoru pro neuropeptid FF (NPFF2). Fyziologicky se vyskytuje ve dvou isoformách (PrRP31 a PrRP20) a pro vazbu na receptor je nejdůležitější jeho C-koncová sekvence. Nejkratší fragment se zachovanou vysokou afinitou k receptoru je PrRP13. V naší laboratoři byly syntetizovány analogy PrRP13, které jsou v rámci této práce podrobeny vazebným a funkčním testům a je zjišťován jejich potenciální agonistický či antagonistický účinek.
9:00 Bc. Ruslan Klassen M1 PharmDr. Jindřiška Angelini, Ph.D. Sledování dynamiky mikrotubulárního cytoskeletu po ošetření kovovými nanočásticemi v rostlinách Arabidopsis thaliana detail

Sledování dynamiky mikrotubulárního cytoskeletu po ošetření kovovými nanočásticemi v rostlinách Arabidopsis thaliana

S růstem výroby kovových nanočástic vzrostl i jejich obsah v okolním prostředí, kde rychle a snadno pronikají do jakéhokoliv organismu nebo znečišťují životní prostředí. Nanočástice, zejména do 50 nm, procházejí biologickými bariérami a interagují s mnoha intracelulárními strukturami – například inhibují enzymy, narušují vodivost membrány, vážou se na proteiny. A mohou nakonec způsobit i buněčnou smrt. Cytoskelet funguje jako určitý senzor změn v okolí buňky a odchylky v jeho dynamice mohou nastartovat celou kaskádu dějů, které buňce pomohou vyrovnat se s nepříznivými podmínkami. Pokusili jsme se zjistit, jak nanočástice ovlivňují dynamiku mikrotubulárního cytoskeletu a jeho schopnost k regenerace v různých intervalech po ošetření kovovými nanočásticemi.



Aktualizováno: 4.5.2020 16:35, : Jitka Čejková

VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

VŠCHT Praha
na sociálních sítích
zobrazit plnou verzi